Antiguamente el Municipio de San José pertenecía al departamento de Comayagua, pero a partir del 28 de mayo de 1869, el soberano congreso nacional, con forma una nueva división política nacional creándose el departamento de la Paz, que incluye el municipio de San José, el cual administrativamente pertenecía al distrito de Marcala

a partir del 23 de marzo de 1926 el congreso nacional emite una nueva división política militar y territorial desligando algunos municipios de Marcala como son Santiago de Puringla y Chinacla, quedando la nueva división conformada por San José , y Cabañas, Santa Elena, y Opatoro, en le archivo municipal ahora registro nacional de las personas se encuentra únicamente el tomo #1 de las inscripciones que data desde el 31 de marzo de 1884 hasta el 20 de diciembre de 1898

no se conoce con exactitud la creación del municipio de San José pero datos consideran que fue en el año 1869, San José mucho antes de 1635 era cabecera del curato de Chinacla, pero lo que se cree que seguidamente fue declarado municipio.

MISION

El Municipio de San José busca el buen aprovechamiento de los recursos existentes en la localidad a través del buen funcionamiento del gobierno local correlacionado de alianzas y convenios con organizaciones no gubernamentales(ONG) para el mejoramiento de la calidad de vida de los habitantes

VISION

Ser un Municipio con educación y salud de calidad, con eficiente y amplia cobertura de los servicios básicos, vías de comunicación e infraestructura social en ópticas condiciones, generador de empleo, con una producción agrícola sostenible y diversificada, fomentando la participación ciudadana para garantizar la calidad de vida de los habitantes

La Municipalidad de San José pone a disposición el siguiente portal único de transparencia a la ciudadanía en general, toda la información que según la ley de transparencia se debe publicar